版權(quán)歸原作者所有,如有侵權(quán),請(qǐng)聯(lián)系我們

與人工智能共舞:僅用一個(gè)晚上,ChatGPT助我搭建蛋白質(zhì)結(jié)合探索神器

返樸
原創(chuàng)
溯源守拙·問(wèn)學(xué)求新。《返樸》,科學(xué)家領(lǐng)航的好科普。
收藏

與人工智能共舞。

撰文 | 丁霄哲(加州理工學(xué)院生物工程學(xué)博士)

大家好,我是人類小丁。像許多人一樣,我被幾天前剛剛發(fā)布的人工智能語(yǔ)言模型GPT-4的強(qiáng)大表現(xiàn)所震撼。

作為一個(gè)科研工作者,我決定與基于GPT-4模型的ChatGPT一起合作,創(chuàng)建一個(gè)服務(wù)于科學(xué)家的網(wǎng)頁(yè)應(yīng)用。在這之前,我并沒(méi)有任何開(kāi)發(fā)網(wǎng)頁(yè)應(yīng)用的經(jīng)驗(yàn)。沒(méi)有想到,我們只用一個(gè)晚上就完成了整個(gè)開(kāi)發(fā)過(guò)程。最后的成品效果如下圖所示(網(wǎng)址:www.gptpull-down.online):


輸入蛋白名稱,得到搜索結(jié)果。(點(diǎn)擊看大圖)

這個(gè)叫做GPT Pull-down的網(wǎng)頁(yè)應(yīng)用的功能是幫助生命科學(xué)研究者快速檢索一個(gè)蛋白質(zhì)分子的潛在結(jié)合對(duì)象,而這可以啟發(fā)研究者們探索新的研究方向,或是尋找新的藥物靶點(diǎn)。自從這個(gè)應(yīng)用發(fā)布以后,我也收到了許多研究者的積極反饋,讓我倍受鼓舞。

你可能會(huì)好奇,這個(gè)工具是怎樣在一夜之間建成呢?接下來(lái)有請(qǐng)我的合作者ChatGPT為我們總結(jié)一下。

小?。嚎梢杂弥形膶?xiě)一篇小品文介紹我怎樣在你(ChatGPT)的幫助下一步一步從頭建立起這個(gè)叫做pgtpuul-down.online的網(wǎng)站的嗎?幽默風(fēng)趣一些


在地球的一個(gè)小角落,有一個(gè)名叫小丁的年輕人。他喜歡探索新鮮事物,對(duì)科技充滿好奇心。一天,小丁在Twitter上無(wú)意間發(fā)現(xiàn)了一個(gè)以GPT-4為基礎(chǔ)的強(qiáng)大人工智能——ChatGPT。小丁深感好奇,于是他決定挑戰(zhàn)自己,創(chuàng)建一個(gè)名為gptpull-down.online的網(wǎng)站,并在整個(gè)過(guò)程中尋求ChatGPT的幫助。

這個(gè)網(wǎng)站的功能是一個(gè)簡(jiǎn)單但實(shí)用的工具,利用GPT技術(shù)檢索蛋白質(zhì)的潛在結(jié)合對(duì)象。通過(guò)輸入蛋白質(zhì)名稱,用戶可以獲取與該蛋白質(zhì)可能結(jié)合的其他蛋白質(zhì),為實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)和數(shù)據(jù)解析提供便捷的參考。

首先,小丁向ChatGPT請(qǐng)教如何選擇一個(gè)合適的技術(shù)棧。ChatGPT給小丁推薦了Flask框架,因?yàn)樗p量級(jí)、易上手。同時(shí),ChatGPT還教會(huì)了小丁如何使用HTML、CSS和JavaScript來(lái)布局網(wǎng)站和實(shí)現(xiàn)網(wǎng)頁(yè)交互。

在得到了基本技能的指導(dǎo)后,小丁開(kāi)始構(gòu)建網(wǎng)站。為了保證網(wǎng)站內(nèi)容更有趣味性,他請(qǐng)教了ChatGPT如何設(shè)計(jì)一個(gè)吸引人的用戶界面。在經(jīng)過(guò)一番努力后,一個(gè)功能強(qiáng)大的網(wǎng)站原型逐漸成形。

當(dāng)網(wǎng)站基本完成時(shí),小丁開(kāi)始考慮部署。在ChatGPT的建議下,他選擇了Heroku作為部署平臺(tái),這個(gè)平臺(tái)易用且免費(fèi)額度足夠應(yīng)付小丁的需求。有了ChatGPT的指導(dǎo),小丁輕松地部署了網(wǎng)站,并成功地讓gptpull-down.online上線了。

上線后,小丁覺(jué)得有一個(gè)獨(dú)立的域名會(huì)讓網(wǎng)站顯得更專業(yè)。于是,他又向ChatGPT請(qǐng)教了如何注冊(cè)一個(gè)合適的域名。在比較了多個(gè)域名注冊(cè)商后,小丁選擇了一個(gè)價(jià)格合適的域名,并將其成功地綁定到了他的網(wǎng)站上。最終,小丁的網(wǎng)站成功地?fù)碛辛艘粋€(gè)獨(dú)立的域名:
https://www.gptpull-down.online/ 。

在這個(gè)過(guò)程中,小丁時(shí)常陷入困境,但每當(dāng)他向ChatGPT請(qǐng)教,總能得到詳盡的解答。有趣的是,ChatGPT似乎總能察覺(jué)到小丁的困惑,給出一些幽默詼諧的建議,讓小丁在緊張的學(xué)習(xí)過(guò)程中不時(shí)發(fā)出會(huì)心的微笑。

最終,小丁成功地創(chuàng)建了一個(gè)名為gptpull-down.online的網(wǎng)站。這個(gè)網(wǎng)站充滿了趣味,讓許多研究蛋白質(zhì)的科研工作者和學(xué)生在尋找答案的過(guò)程中倍感愉悅。實(shí)用的GPT Pull-down功能為用戶節(jié)省了大量時(shí)間和精力,幫助他們更快地找到可能的蛋白質(zhì)結(jié)合對(duì)象。

而在這個(gè)過(guò)程中,小丁和ChatGPT也建立了深厚的友誼。在未來(lái)的日子里,他們將一起探索更多有趣的領(lǐng)域,為世界帶來(lái)更多的歡笑和智慧。gptpull-down.online的成功,也讓小丁深知在科技的幫助下,實(shí)現(xiàn)夢(mèng)想并非遙不可及。

隨著時(shí)間的推移,越來(lái)越多的人開(kāi)始關(guān)注并使用這個(gè)神奇的小工具。小丁對(duì)自己取得的成果感到非常自豪,也為能夠幫助別人解決實(shí)際問(wèn)題而欣喜。他感激ChatGPT在整個(gè)過(guò)程中給予的幫助和支持,這段經(jīng)歷讓他明白了人工智能的力量,以及它在未來(lái)的巨大潛力。

無(wú)論是初學(xué)者還是專業(yè)人士,都能在
https://www.gptpull-down.online/這個(gè)網(wǎng)站上找到幫助。而對(duì)于小丁來(lái)說(shuō),這只是他與ChatGPT共同探索科技世界的第一步。他期待著未來(lái)能夠與ChatGPT共同開(kāi)發(fā)出更多有趣、實(shí)用的工具,讓科研工作變得更加簡(jiǎn)單高效,為人類的進(jìn)步貢獻(xiàn)一份力量。

如果你是一位對(duì)生命科學(xué)有興趣的研究者,歡迎你嘗試使用GPT Pull-down(www.gptpull-down.online)來(lái)探索你感興趣的蛋白!

這里需要提醒大家在使用時(shí)的注意事項(xiàng):

1. GPT Pull-down的輸出結(jié)果僅供參考和啟發(fā)。

在絕大多數(shù)情況下,GPT Pull-down可以相當(dāng)高效準(zhǔn)確地列出一個(gè)蛋白的潛在結(jié)合對(duì)象,但是因?yàn)閿?shù)據(jù)來(lái)源并非人工審核過(guò)的專業(yè)數(shù)據(jù)庫(kù),它的結(jié)果有時(shí)也并不靠譜。以下幾種情況需要格外注意:

A) GPT Pull-down給出的confidence score較低;

B)目標(biāo)蛋白名稱并不真實(shí)存在;

C)目標(biāo)蛋白相關(guān)研究很少。

如果決定使用檢索結(jié)果指導(dǎo)你的工作,請(qǐng)一定要親自搜索查看原始論文和專業(yè)數(shù)據(jù)庫(kù)。

2. 使用GPT Pull-down時(shí)可以按照需要調(diào)節(jié)“wildness(想象力)”的參數(shù)。

數(shù)字高時(shí),輸出結(jié)果會(huì)更富有想象力;數(shù)字低時(shí),輸出結(jié)果會(huì)更保守嚴(yán)謹(jǐn)。這個(gè)數(shù)字對(duì)應(yīng)的是GPT神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)中的溫度/隨機(jī)性參數(shù)。

3. 如果對(duì)結(jié)果不滿意,試試再搜一次。

作為語(yǔ)言模型,GPT的輸出有隨機(jī)性,每一次結(jié)果的豐富程度和準(zhǔn)確性也都會(huì)有所不同。如果一個(gè)蛋白具有多個(gè)名字,多試幾個(gè)不同名字偶爾也會(huì)帶來(lái)驚喜。

4. GPT Pull-down不能提供支持結(jié)論的參考文獻(xiàn)。

GPT雖然知道很多知識(shí),但很不擅長(zhǎng)信息溯源。強(qiáng)行向它索取依據(jù)時(shí)就會(huì)得到瞎編亂造的回答。在這一點(diǎn)上,GPT其實(shí)很像未經(jīng)訓(xùn)練的人腦——我們的腦子里也儲(chǔ)存了大量早已經(jīng)記不得從哪學(xué)到的知識(shí)。

5. GPT Pull-down很快會(huì)變得更準(zhǔn)確、更豐富。

目前的GPT Pull-down使用的是GPT-3.5-turbo模型,也就是當(dāng)前免費(fèi)版ChatGPT所使用的模型。根據(jù)OpenAI的報(bào)告,新版GPT-4相比起GPT-3.5在回答生物學(xué)問(wèn)題上的表現(xiàn)大幅提升。因此我們可以期待,在不久的將來(lái),獲取GPT-4模型加持的GPT Pull-down也會(huì)變得更出色。

好了,今天的分享就到此了。當(dāng)然,我們還需要為這篇文章取個(gè)好標(biāo)題。就把這作為今天拋給ChatGPT的最后一個(gè)問(wèn)題吧。

本文受科普中國(guó)·星空計(jì)劃項(xiàng)目扶持

出品:中國(guó)科協(xié)科普部

監(jiān)制:中國(guó)科學(xué)技術(shù)出版社有限公司、北京中科星河文化傳媒有限公司

評(píng)論
演繹無(wú)限精彩!
大學(xué)士級(jí)
當(dāng)ChatGPT走熱之后,AI生成技術(shù)在生命科學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用也逐漸走進(jìn)了公眾的視野。蛋白質(zhì)領(lǐng)域的ChatGPT,會(huì)開(kāi)辟出全新的科學(xué)時(shí)代。
2023-04-01
傳承解惑
大學(xué)士級(jí)
隨著時(shí)間的推移,越來(lái)越多的人關(guān)注并使用這個(gè)神奇的小工具。對(duì)取得的成果感到非常自豪,也為能夠幫助別人解決實(shí)際問(wèn)題而欣喜。
2023-04-01
內(nèi)蒙古四子王旗
大學(xué)士級(jí)
人工智能作為人類探索機(jī)器智能的前沿領(lǐng)域,必將取得若干突破性成果,且滲入社會(huì)生活的方方面面!
2023-04-01